Execute a instalação do SQL Server a partir da linha de comando. A coisa toda pode ser feita através de um monte de interruptores. Salve isso como um arquivo em lotes e simplesmente execute o arquivo em lotes.
Quanto à configuração do SQL Server, basta escrever um script T / SQL para manipular toda a configuração. Qualquer coisa que você pode configurar do SSMS, você pode configurar via T / SQL. Apenas leva um pouco de pesquisa.
Quando trabalhei para o MySpace, a instalação do SQL Server foi feita dessa maneira. Em seguida, eles configurariam tudo manualmente no SQL Server. Isso levou cerca de 3 horas. Passei alguns dias escrevendo um script SQL para lidar com tudo isso e diminuí para cerca de 5 minutos por servidor.
Eu usei um script semelhante em outra empresa para configurar os SQL Servers e funcionou muito bem. É só uma questão de quanto você coloca no script e o que você tem configurado.
Em ambos os casos, configurei os locais padrão do banco de dados, e-mail do banco de dados, crie tarefas básicas de manutenção, defina alertas, crie operadores do SQL Agent, etc. O para o MySpace também se conectou ao servidor central de banco de dados e obteve as cópias mais recentes dos bancos de dados e os restaurou com os nomes corretos.