Diretamente do painel, você não pode, na verdade, não há nenhuma chamada em vigor que lhe permita fazer isso. O GNOME 3 também não. Então, onde estão esses valores armazenados? Eles normalmente são chamados de "application.desktop", então, para copiá-los para a área de trabalho, você só precisa:
➜ ~ locate gparted.desktop ## Find where it's
/usr/share/app-install/desktop/gparted.desktop
/usr/share/applications/gparted.desktop # This is the default path for installed applications
➜ ~ cp /usr/share/applications/gparted.desktop ~/Desktop # Done
Isso fará uma cópia na área de trabalho do arquivo .desktop
e deverá ser interpretado como um "atalho" para o programa.
Mais sobre isso na página de especificações de arquivos .desktop: link