Existe uma maneira de construir um servidor Windows que pode ser alvo para outros servidores de arquivos do Windows com o rsync?
Embora o MarkM tenha um bom argumento sobre o DFS-R, se você ainda quiser usar o rsync, então cwrsync é uma ótima versão para Windows do rsync, que inclui um cliente & servidor, e também pode usar criptografia. Eu usei este pacote no Windows por anos. Funciona muito bem, mas (na minha experiência) às vezes pode ter tempos de transferência de arquivos mais lentos do que o esperado.
Existe algum motivo para você querer usar o rsync? Se eu fosse você, escolheria o DFS-R
Eu encontrei uma ótima ferramenta Yintersync - Rsych for Windows para gerenciar a replicação de vários servidores Windows de volta para um. Eu replico mais de 2tb diariamente de 10 servidores em uma conexão de banda larga de 2mbit usando-a.
Use DeltaCopy - link
O pacote backuppc tem um link para uma implementação mínima de rsyncd. Ele é baseado no cygwin e fornece apenas o serviço daemon rsyncd. É uma implementação de 32 bits, mas funciona bem no Windows 7 de 64 bits.
Existe também um link para outro conjunto de pacotes que inclui também um serviço sshd.