Você pode alterar o UUID de um vdi usando o comando
VBoxManage internalcommands setvdiuuid disk.vdi
ou se você estiver usando o VBox V4.x pelo menos para 4.0.10
VBoxManage internalcommands sethduuid disk.vdi
use a GUI para importar o novo disco 'exclusivo'.
Se você quiser clonar uma máquina VirtualBox em particular, provavelmente é melhor fazer uma aplicação dela e depois usá-la. Para fazer com que um appliance use o recurso GUI Export Appliance ou o comando vboxmanage export
. O appliance resultante pode ser importado usando o recurso GUI Import Appliance ou o comando vboxmanage import
.