Eu não acho que é possível fazer o que você está pedindo.
Você pode usar as opções de montagem para mapear usuários e definir permissões, mas não acredito que você possa alterar os parâmetros do Windows.
Veja a documentação do NTFS-3g para detalhes:
Limitações
Os SIDs necessários para identificar usuários e grupos precisam ser criados no Windows. No entanto, um arquivo de mapeamento de usuário pode ser copiado em qualquer partição, mesmo que nunca tenha sido formatado ou usado pelo Windows.
Algumas configurações incomuns de direitos básicos, em que o grupo tem direitos negados ao proprietário e ao mundo (como no chmod 745,) são rejeitadas pelas ferramentas de administração do Windows. Eles são, no entanto, interpretados corretamente pelo próprio Windows. Ao usar ACLs POSIX, mais configurações são rejeitadas pelas ferramentas de administração do Windows.
A versão base é mais adequada para sistemas de inicialização dupla com vários usuários, configurações complexas de usuário tiram proveito das ACLs POSIX. Os recursos de mapeamento de usuários necessários para dispositivos que podem ser conectados a vários sistemas Windows ou Linux ainda não estão disponíveis.