ext2 será o sistema de arquivos mais rápido (e mais barato). Não há necessidade de registro no diário do ext3, já que o banco de dados já cuida disso sozinho.
Além disso, o que o usuário "alguém" disse está correto. A unidade será mais rápida se você inicializar primeiro. No entanto, se você planeja tirar fotos, lembre-se de que inicializar, mesmo com 0s, tornará os instantâneos maiores (e, portanto, mais caros), porque agora todos os blocos foram alterados.