Depende de qual SO a VM é, até certo ponto, mas sim, você pode. Eu realmente faria isso com uma cópia do disco rígido da VM montada diretamente em outro computador com acesso total a coisas como o windows update, mas o WinPE deveria funcionar também.
Instruções detalhadas sobre como fazer isso estão aqui em: link mas você essencialmente usa
Dism /Image:W:\ /Cleanup-Image /RestoreHealth
onde W: \ é sua unidade offline montada. Isso deve permitir que você corrija a partir do windows update Se isso não funcionar, você pode usar o sinalizador / Source: para especificar uma fonte. Combinado com
DISM /mount-Image /ImageFile:D:\sources\install.wim /index:1 /mountdir:C:\WIM\ /readonly
onde D: \ é um disco de instalação e C: \ WIM é um diretório vazio
você deve ser capaz de usar
Dism /Image:W:\ /Cleanup-Image /RestoreHealth /Source:C:\WIM\windows