Depois de muitos testes, encontrei uma solução para o meu problema:
- Rhythmbox ou Banshee para música
- gPodder para podcasts
Esta configuração funciona bem com a 5ª geração do iPod Nano
Detalhes:
- O Banshee corrompe a biblioteca do iPod se você sincronizar podcasts (3 vezes o mesmo podcast, podcast em música e música no podcast, capas erradas ...)
- O Rhythmbox sincroniza todos os podcasts, mas converte podcasts de vídeo em podcasts de áudio (processo de sincronização muito longo com alto uso da CPU)
- gPodder versão 2.9 funciona bem com podcasts de áudio e vídeo (adicione gPodder ppa para a versão 2.9: deb link principal maverick)