Parece que a resposta é usar um sistema de arquivos que você usaria com o disco normal.
Linus parece secundar essa ideia.
Veja o artigo de Theodore Ts'o sobre esse assunto .
Em sua outra entrada no blog ele escreve como alinhar ao tamanho do bloco de apagamento do ssd .
Parece-me que os SSDs modernos são inteligentes e não devem se importar. Minha escolha de sistema de arquivos é XFS btw.
Existem duas opções de montagem: relatime, noatime que podem ser usadas para reduzir as gravações em disco às custas da semântica modificada de posix. As gravações em disco reduzidas são consideradas uma boa ideia com o Theodore Ts'o do SSD. bechmarks sobre o assunto.