Eu tive o mesmo problema agora. Eu acho que o problema é que o compiz não funciona corretamente através da conexão RDP, pois precisa de uma placa 3D. Existem algumas soluções que lhe dizem para alterar as informações da sessão do gnome. Fazendo isso você terá uma conta que, quando você fizer login no computador local, não terá nenhum dos efeitos agradáveis da sua placa 3D.
O que eu fiz para aliviar o problema foi. No computador local do Ubuntu:
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Crie um novo usuário em > Configurações do sistema > Contas de usuário (com as mesmas permissões da sua conta normal. Acabei de usar "username-rdp", em que "username" é seu nome de usuário atual)
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Verifique se o usuário está ativado, fornecendo uma senha na janela Contas do usuário.
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faça login com essa nova conta de usuário
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vá até o terminal e execute:
echo "gnome-session --session=ubuntu-2d" > ~/.xsession -
Reinicie o computador.
Isso deve deixar seu computador em um estado em que seu usuário normal esteja intacto e ainda possa fazer o 3D e o Compiz. Seu novo usuário trabalhará através da conexão RDP e será limitado à sessão 2D do Ubuntu sem prejudicar seu usuário normal.
Se você não se importa com 3D, siga as etapas 4 e 5. e use sua conta de usuário normal em RDP.