De acordo com esta página , você precisa ter o Flash Player 11.3 ou superior Para que os apresentadores sem fio trabalhem com o Prezi em tela cheia.
Infelizmente, o suporte ao Flash Player para Linux parou um pouco antes disso e, se você usa o Firefox ou o Chromium, fica preso na versão 11.2. Uma maneira fácil de contornar isso é instalando o Google Chrome. Ao contrário do Chromium ou Firefox, o Chrome vem com seu próprio Flash Player atualizado (atualmente, versão 12).
O Google Chrome não está disponível no Ubuntu Software Center, então você precisará obtê-lo em outro lugar. Recomendo o site oficial: link