Algumas coisas precisam ser consideradas:
1) Os usuários terão que fazer o login com o novo nome e devem ser informados.
2) Se eles usarem o Exchange, seus endereços de e-mail também serão alterados (acredito).
3) se eles não usam o Exchange, mas outro sistema de e-mail, a autenticação pode ser incompatível e mapeada incorretamente. Isso depende muito do seu ambiente.
4) Mais uma vez, específico do ambiente, mas você também deve estar atento a quaisquer aplicativos de terceiros que sejam autenticados no AD. Alguns se comportarão bem; outros não.
A melhor maneira é testar com uma única conta e ver o que quebra. Para mim, não vale a pena se não está quebrando nada.
Edit: Além disso, isso poderia interromper os redirecionamentos se os perfis em uso e em roaming.