Não, não, não. Apenas ... não.
A pasta WinSxS (também conhecida como pasta de montagem lado a lado do Windows) é necessária se você quiser servidor para trabalhar.
Se você quiser tentar reduzir seu tamanho, pode executar uma limpeza , mas estou muito preocupado com seus dados. Uma dúzia de GB é não grande - e ter muitos dados é mais uma razão para fazer algo, não uma desculpa para excluí-lo. Perder mais dados é pior do que perder menos dados, afinal.
Se você não conseguir fazer o backup desse diretório e precisar restaurar o servidor, não terá um servidor em funcionamento após terminar. Basta fazer o backup e comprar uma fita LTO / disco rígido externo / o que quer que você coloque seus backups. Eles são baratos o suficiente e certamente mais baratos do que ter um servidor emparedado.