Enquanto as outras respostas oferecem uma boa solução para o seu problema, para responder à sua pergunta, o jeito certo de usar um alias dentro de um arquivo .desktop é, no seu caso:
Exec=bash -ic "midos"
Isso porque os aliases do arquivo ~/.bashrc
funcionarão somente
em um shell interativo bash (a opção -i
é usada neste caso para iniciar o bash interactive).
Se outro usuário quiser usar o mesmo arquivo .desktop, ele deve ter definido também esse alias.