Eu uso o Ubuntu 12.04 (Unity). Como eu faria isso quando eu pressionei o botão fechar para minimizar a janela, como é o caso do Mac OS. O programa está fechado, mas ainda está sendo executado na memória até que seja completamente fechado clicando com o botão direito e em Sair. Isso seria particularmente útil especialmente para programas como o Thunderbird e vários clientes do Twitter. P.S. Desculpe pelo meu mau inglês.
Um truque simples que eu uso quando eu quero ter um programa em execução, mas fora de vista, ele está enviando para outro espaço de trabalho. Eu costumo usar dois espaços de trabalho, um para os programas que estou trabalhando e outro para os "dormentes".