O cliente do Windows Update pode ser configurado para executar instalações em horários estranhos. Combinado com uma solução para fazer o Wake-on-LAN, você pode obter uma implantação de atualização para ocorrer fora do horário normal com bastante facilidade. (Usamos alguns scripts para fazer isso, mas provavelmente existem soluções prontas para uso também).
O WSUS tem sido extremamente confiável para mim. Gosto particularmente da funcionalidade de geração de relatórios na localização de computadores que não estão recebendo atualizações corretamente.
O cliente do Windows Update é facilmente gerenciável com a política de grupo, o que nos deixa muito felizes também.
Existem produtos de terceiros e da Micrsoft (o SCCM vem à mente) que fazem mais do que apenas opor o gerenciamento de patches do sistema. Eu não tenho nenhuma experiência para me relacionar sobre isso. Estes produtos parecem estar fora do preço para o tamanho dos clientes com os quais estou trabalhando. (Geralmente, lidamos com aplicativos de patches por meio de scripts de inicialização ou reimplementação de atribuições de software corrigidas por meio de GPOs ...)