A principal reivindicação da fama do UnxUtils é que ele fica em cima do MSVCRT.dll, em vez do glibc. Isso significa que ele está ciente dos caminhos nativos do Windows (por exemplo, você pode usar comandos como ls c :). Alguns (particularmente cygwin e SFU) mapeiam nomes de caminho DOS nativos sob uma estrutura de árvore semelhante a um unix.
O suporte nativo ao caminho DOS é útil se você deseja executar comandos unix a partir de arquivos .cmd (o que é bastante útil às vezes) Note que essa é uma diferença em relação a SFU ou Cygwin. Não tenho certeza se o CoreUtils faz isso e a documentação da web não está clara. Em caso afirmativo, você provavelmente ficará melhor com o CoreUtils, pois a manutenção no UnxUtils é bastante esparsa (por exemplo, sem versões nativas de 64 bits). No entanto, o UnxUtils é bastante estável e funciona bem em sistemas de 64 bits.
EDITAR: embora a documentação não seja explícita, recursos da web auxiliares implicam em suporte para caminhos do DOS, então o CoreUtils provavelmente faz isso.