Não, eles não vão. Após a reinicialização, você começa do zero.
Normalmente, para os módulos que você deseja carregar após cada reinicialização, há um módulo de listagem de arquivos de configuração a ser carregado automaticamente no momento da inicialização.
Veja /etc/modules
.
man modules
:
NAME
/etc/modules - kernel modules to load at boot time
DESCRIPTION
The /etc/modules file contains the names of kernel modules that are to
be loaded at boot time, one per line. Arguments can be given in the
same line as the module name. Lines beginning with a '#' are ignored.