Você precisa usar o argumento --geometry com o comando gnome-terminal.
Exemplo: gnome-terminal --geometry 114x26+170+30
Isso abrirá o terminal gnome com 114 colunas de largura por 26 linhas de profundidade e o colocará bem próximo ao meio da tela, com base no 170 + 30. Uma dica bem legal para obter sua geometria exata de onde você quer que seu terminal vá em frente e abra o terminal gnome e coloque-o exatamente onde você quer e então execute o comando xwininfo
no terminal. Clique no gnome-terminal com o mouse e ele mostrará toda uma lista de coisas sobre aquela janela em particular. A geometria da janela está listada na parte inferior. Basta copiar a linha e anexá-la ao seu comando gnome-terminal. Tah Dah !!!