Faça login com uma conta root com sudo bash
. Você também pode fazer isso de um CD ao vivo.
Ou você precisa reinicializar e emitir um sudo bash
com o primeiro comando (parece que esse bug só aparece depois da segunda vez que você usa sudo
).
sudo gedit /etc/pam.d/common-session-noninteractive
procure pela linha 16 (ish) e altere
[default=1]
para
[default=0]
Tente um comando com sudo
e ele deve funcionar normalmente.