Eu tive o mesmo problema. Digitei: ps -aux no terminal, ai encontrei o PID dos processos reiniciando o mysql e matei um deles (o primeiro deles, havia três deles), a instalação prosseguiu e então ocorreu o mesmo problema mais uma vez. Eu fiz exatamente a mesma coisa - matei o processo; desde então, tudo está indo bem - espero que fique bem após a instalação.