Tente o seguinte:
echo 1 > /proc/sys/net/ipv4/tcp_tw_recycle
echo 1 > /proc/sys/net/ipv4/tcp_tw_reuse
Provavelmente, ajudará a reduzir o número de conexões TIME_WAIT.
Você também pode tornar essas alterações permanentes em /etc/sysctl.conf
:
net.ipv4.tcp_tw_reuse=1
net.ipv4.tcp_tw_recycle=1