Não vejo por que não, desde que o controlador RAID seja capaz de usá-los no RAID 1: se ambos rodarem em um controlador SATA, e ele puder fazer RAID 1 nesses canais, sim; se um for executado em um controlador PATA e o outro em um controlador SATA, e a placa-mãe não puder fazer o RAID 1 porque eles estão em controladores diferentes, então não.
Mas, não é recomendado devido às grandes diferenças entre as duas unidades, o que resultará em velocidades mais lentas. Geralmente, é recomendável usar unidades semelhantes ao configurar um ataque.