A corrupção de NTFS pode ser causada por problemas de hardware, como problemas com o cabo, o controlador ou uma falha no disco rígido (problemas mecânicos, ...). Se o cache de gravação estiver habilitado na unidade, o hardware não conseguirá manter a gravação dos dados no disco.
Outras razões comuns que eu poderia pensar são mal funcionamento do sistema (telas azuis, controladores / drivers RAID com problemas) e quedas de energia que podem deixar o sistema de arquivos em um estado inconsistente.
Verifique no log de eventos do Windows o período anterior à falha. Poderia conter algumas informações úteis sobre o que exatamente deu errado. E faça backup dos seus dados, se ainda não o fez. Existem erros que podem ser o primeiro sinal de uma falha completa do disco rígido. Execute um software de diagnóstico de disco rígido para detectar se alguns dos parâmetros de confiabilidade não são aceitáveis. Você pode usar o Monitor Active @ Hard Disk para executar algumas verificações.