Parece que o sistema de arquivos foi escolhido e o fsck não o reparou completamente.
Neste ponto, ficaria tentado a verificar os logs para ver se todos os discos estão funcionando fisicamente (ruídos? status SMART? erros nos logs referentes a redefinições? etc.) e restaurar a partir do backup, em vez de gastar mais tempo tentando para endireitar os resultados do fsck.