Você deve usar 75-80% ou RAM como o tamanho máximo do buffer pool se o servidor for dedicado a fazer o MySQL
Por favor coloque estas duas linhas em /etc/my.cnf (my.ini)
[mysqld]
innodb_buffer_pool_size=200M
innodb_log_file_size=50M
Se você quiser usar a recomendação de 100MB para o InnoDB, use-o em seguida
[mysqld]
innodb_buffer_pool_size=100M
innodb_log_file_size=25M
Certifique-se de redimensionar os arquivos de log innodb da seguinte forma:
service mysql stop
rm -f /var/lib/mysql/ib_logfile*
service mysql start
(Editar: erro de digitação fixo no comando rm)