Você instalou o ppa xorg-edgers?
Do PPA: 13 de julho: O Mesa atualmente tem problemas com a unidade onde os ícones do lançador são invisíveis, sugere-se que mantenha o mesa de volta à versão 0529, pare de usar este PPA ou use outra sessão como gnome ou unity-2d até que seja corrigido. p>
Eu ainda não tentei, mas esse poderia ser o problema.