Tecnicamente você pode criar vários registros PTR que apontam para o mesmo IP e colocar em cada um o nome do site ou o que quer que seja. Mas não há realmente nenhuma razão para fazer isso.
Crie um registro PTR para o endereço IP e coloque nele o nome do host do servidor.
É comum hospedar vários sites em um único IP ou ter um IP usado para enviar e-mails para muitos domínios de e-mail. As pessoas geralmente não criam dezenas / centenas / milhares de registros PTR para essa situação, apenas criam um que mapeia para o nome do servidor.
Além disso, você menciona os servidores nos quais você está hospedando o DNS. Isso é ótimo, mas você provavelmente não estará criando o registro PTR lá. Muito provavelmente, a entidade que detém as zonas reversas para esse IP é quem você obteve esse endereço IP (a empresa VPS ou seu ISP ou qualquer outro), então provavelmente você estará solicitando que crie o registro PTR em seu nome que é comum.