Ativar a auditoria (acesso a objetos de auditoria) não ativa a auditoria para nada até que você defina as configurações de auditoria nesse objeto (arquivos, pastas, impressoras, etc.). Assim, você pode ativar a auditoria e definir as configurações de auditoria somente nos arquivos e pastas que deseja auditar.
Isso faz sentido?
Primeiro, você ativa a auditoria, que por si só não audita nada, então você configura as configurações de auditoria no objeto que deseja auditar.