Você verificou as permissões de compartilhamento e NTFS para permitir o acesso de leitura de usuários autenticados?
E você verificou as permissões para o script de inicialização real no SYSVOL?
Verifique também se as configurações a seguir estão sendo aplicadas corretamente:
Configuração do Computador \ Modelos Administrativos \ Sistema \ Logon \ Sempre aguarde a rede na inicialização e no logon do computador = > ativado
Configuração do Computador \ Modelos Administrativos \ Sistema \ Scripts \ Execute scripts de inicialização de forma assíncrona = > desativado