O Plesk é um painel de administração, algo semelhante ao DirectAdmin. Permite que você (e seus usuários) administrem o servidor via www, no navegador. link
O repositório é algo como um banco de dados de vários programas linux (neste caso apenas, o repositório como um termo é muito mais amplo). Seu software, responsável por gerenciar (baixar e instalar) outro repositório de softwares para download. O referido software pode ser apt, ou gerenciador de pacotes Synaptic, ou qualquer outra coisa.
Então, em inglês simples, é assim: adicione o endereço do repositório atômico à sua lista de repositórios para que você possa facilmente baixar e instalar o painel de controle do Plesk:)