Então, primeiro, SECURE ERASE faz exatamente o que parece, deixa toda a unidade em branco. Eu realmente aconselho a não degradar intencionalmente sua matriz RAID assim.
Em que nota, se você for fazer isso, faça um favor a si mesmo e deixe o RAID offline, dessa forma você não precisará sincronizá-lo novamente depois de fazer o TRIM em cada disco.
Eu não posso comentar sobre o desempenho da implementação do seu cartão RAID5, mas certamente seria sensato tentar RAID10 e comparar o desempenho. Uma coisa é muito provável: o desempenho do RAID10 em estado degradado será muito melhor do que para o RAID5
Finalmente, acho que é um pouco evidente que o que você está fazendo não é sustentável a longo prazo e você precisa pensar em encontrar uma solução de redundância de disco que suporte TRIM.