Isso ajuda se você adicionar ". *"?
RewriteRule .*\.(gif|png|jpg|jar|sis|mp3|thm)$ - [F]
Além disso, sua linha:
ReWriteCond %{REQUEST_URI} ^/files/*
significa (no final) "uma barra zero ou mais vezes". Você pode tentar:
ReWriteCond %{REQUEST_URI} ^/files/.*
que significa "uma barra, em seguida, qualquer caractere zero ou mais vezes".
Editar : alguns dos seus arquivos podem ser nomeados com extensões em maiúsculas. Você pode tentar:
RewriteRule .*\.(gif|png|jpg|jar|sis|mp3|thm)$ - [F,NC]