Verifique se o novo FTP tem acesso de leitura / gravação à pasta raiz do ftp (permissões NTFS no disco). Além disso, alguns dos modos de isolamento do usuário exigem que o usuário também receba acesso de 'permissões de lista' à raiz do site.
Existe um bug menor que pode pegar você com a autorização também. Apenas para testes, abra-os bem abertos. Depois que você conseguir trabalhar, troque-a novamente.