A Microsoft oferece muitas informações úteis aqui: link
Na minha cabeça, acredito que você queira listras de 32KB e desejará que as partições estejam alinhadas com os limites da faixa. Não tome minha palavra - leia o guia. Eu posso ser um idiota às vezes. (sorriso)
Edit: eu disse 64KB primeiro. Deve ser 32KB. Veja, eu sou um idiota.
Veja também: link
Um aparte: A leitura da postagem de Evan Dodds novamente me fez lembrar que eu vi uma situação de desempenho adverso em uma instalação do Exchange 2003 em que as filas SMTP foram colocadas no mesmo eixo que os logs de transação. Lembro-me de você dizendo que esta caixa vai ser um servidor back-end, mas, obviamente, ainda estará recebendo e-mails recebidos de seus servidores front-end em filas SMTP. A situação que me lembro é muito parecida com a descrita por Evan Dodds - as filas SMTP estavam no fuso do log de transações e o fuso acabava se debatendo entre tentativas de fazer gravações seqüenciais dos logs de transações e gravações aleatórias nas filas SMTP. Mover as filas SMTP para um eixo próprio acabou tornando a caixa muito mais feliz. (Ele ficou com o tamanho da fila do disco muito baixo nos discos de log de transações e diminuiu o sintoma visível ao usuário - popups de tempo limite de RPC em abundância!) Cuidado com isso.