Após algumas soluções de problemas, descobrimos que o problema ocorreu devido a versões inconsistentes do ESXi Hypervisors nos hosts.
O armazenamento de dados foi compartilhado entre três hosts ESXi. Enquanto fizemos Upgrades do ESXi nos dois hosts, o terceiro ainda ficou com uma versão mais antiga do ESXi, (por razões que não merecem ser mencionadas).
Os dois hosts estavam em VMware-VMvisor-Installer-5.5.0.update02-2068190
e o terceiro ainda estava em VMware-VMvisor-Installer-5.1.0-799733
e isso estava causando o problema.
Depois de finalmente atualizarmos o terceiro host ESXi na versão final, o problema foi corrigido e nunca mais ocorreu novamente.