Não vai acontecer com o rsync.
O Rsync faz o melhor para fazer backup de qualquer tipo de sistema de arquivos e fazer com que pareça o mesmo em outro tipo de sistema de arquivos. Então, o chattr + i é bastante ext * específico, de modo que o rsync os ignora.
O Rsync está mais preocupado com permissões e propriedade do arquivo.
Você teria que criar um script em torno do rsync para fazer esse trabalho