Para responder aos comentários sobre a pergunta original, o armazenamento estava bem e tudo o mais normal. Eu até iniciei um servidor js de nó temporário para testar a velocidade da rede e foi muito rápido. Nenhuma atualização foi instalada antes da reinicialização (dois meses antes).
A resposta acabou sendo reiniciar a máquina pela segunda vez. Apenas "se consertou".
Sempre tente as coisas estúpidas primeiro .. Obrigado pelas idéias