Bem, embora não seja um método de backup comum, se você tiver um computador bastante recente que ofereça suporte à virtualização de hardware, convém considerar criar uma cópia P2V da instalação do Windows.
O que isto faz é criar uma cópia virtualizada de toda a sua instalação física do Windows que você pode reproduzir dentro de um software de gerenciamento / reprodução de VM.
E, sim, tanto o conversor P2V quanto o software do reprodutor VM são gratuitos, embora não sejam de código aberto.
Então, a primeira coisa que você precisa fazer é entrar no Windows e instalar o conversor neste endereço link
(Clique em baixar e entrar em sua conta ou crie um só para isso)
Quando terminar de baixar e instalar, execute o conversor autônomo e escolha Máquina ligada e esta máquina local como a fonte, depois clique próximo .
Na tela seguinte, selecione vmware workstation como o tipo de máquina e selecione também vmware workstation 8.x como o produto. Em seguida, forneça a localização de um disco rígido externo para o qual enviar a cópia ao fazer a conversão. p>
Em seguida, clique duas vezes ao lado e faça outra coisa por um tempo. Pode levar algumas horas para copiar todos os seus dados para um disco rígido externo.
Quando esta etapa estiver concluída, você pode desligar e reiniciar no Ubuntu.
No ubuntu, você precisa instalar o vmware player nesta página link
Sim virtualbox é ótimo, mas não sei se uma máquina vmware pode ser usada a partir dele.
Existem maneiras mais prováveis, mas está além do escopo da minha resposta.
Agora você pode executar o VMware Player e abrir a VM que você tem em sua unidade externa.
Você pode então copiar os arquivos da sua VM para a sua área de trabalho ubuntu e ver como excluir sua partição antiga do Windows.