Você pode listar as sessões atuais do byobu com:
byobu list-session
Você deve ver algo assim:
session_1: 1 windows (created Tue Feb 6 18:05:35 2018) [237x49]
session_2: 1 windows (created Tue Feb 6 18:05:44 2018) [237x49]
session_3: 1 windows (created Tue Feb 6 18:06:05 2018) [237x49]
A primeira palavra em cada linha é o nome da sessão.
Então, para matar uma única sessão, você pode fazer:
byobu kill-session -t <session_name>
Para matar session_2
na lista anterior, você pode fazer:
byobu kill-session -t session_2