Acredito que o Python tenha espaço, portanto, você deve ter várias versões coexistindo sem problemas.
Você pode criar uma versão específica simplesmente especificando a versão desejada:
emerge -av =python-2.5.4-r4
ou com versões mais recentes do portage, pelo nome do espaço em vez da versão #:
emerge -av python:2.5
Alguns links que você pode achar úteis:
- Introdução ao Portage no Manual
- Seção do Portage do Manual
-
emerge
página do manual - Página de portagem do Gentoo-Wiki