Quando eu tinha 12.04 LTS, o pdfsam funcionava muito bem. Agora, com o 16.04 LTS, quando eu instalo o pdfsam do Ubuntu Software Center, o ícone do pdfsam aparece no lançador e o Centro de Software ainda mostra o botão INSTALL para o pdfsam, o que significa que o pdfsam não foi instalado. Se eu clicar no ícone do lançador pdfsam, ele falhará ... Desculpe, o Ubuntu 16.04 sofreu um erro interno. Além disso, é criado um arquivo de log de erros que começa com "Um erro fatal foi detectado pelo Java Runtime Environment". Como devo proceder?
pdfsam simplesmente não funciona em 16.04. Viva com isso e experimente outro aplicativo em pdf como: PDF MOD, PDF Shuffler, PDF Chain ou até mesmo Master PDF Editor (provavelmente o melhor editor de pdf no linux). Eu pessoalmente prefiro o Foxit PDF Editor, que funciona bem no Wine.
Eu tive a mesma experiência. Funcionou bem antes de atualizar para o 16.04, mas não depois. Consegui que funcionasse novamente instalando uma versão mais nova do Java JRE e, em seguida, dizendo ao inicializador para usar o novo JRE. Eu instalei o Java JRE da Oracle (você pode obtê-lo em java.com).
Para informar ao pdfsam para usar o novo Java, edite o arquivo em /usr/bin/pdfsam (talvez seja necessário fazer isso como root). No arquivo da minha máquina, na linha 36, adicionei o seguinte:
JAVA=/home/mike/java/jre1.8.0_101/bin/java
Observe que instalei o Java JRE no meu diretório inicial. Talvez não seja o melhor lugar para fazer isso, mas eu sou a única pessoa que usa essa máquina, então isso funciona bem para mim. Você precisará alterar a linha acima para qualquer local escolhido para instalar o JRE.
O antigo Java JRE ainda está na minha máquina para qualquer programa que ainda precise dele, portanto, isso não deve afetar qualquer outra coisa que você esteja usando no seu computador.
Boa sorte!
No meu caso, o problema estava relacionado ao fato de que o ubuntu 16.04 usa o openjdk 9 por padrão, mas a instalação do jdk 8 resolveu o problema. Aqui está o que eu fiz depois de instalar o pdfsam com defeito:
# apt-get install python-software-properties
# add-apt-repository ppa:webupd8team/java
# apt-get update
# apt-get install oracle-java8-installer
... e receba de volta seu adorável pdfsam