Não use seu "nome de domínio real" para um nome de domínio do Active Directory. A razão que AdamB deu como um "fator PITA" é exatamente a razão para não fazê-lo, e não é apenas um "PITA".
É uma má prática montar um servidor DNS com autoridade para um domínio que já tenha servidores de nomes com autoridade em outro lugar. Se você fizer isso, em breve você vai querer resolver os nomes "já autoritativos" e ter uma bagunça de duplicar manualmente os registros em seus servidores DNS internos.
Se você quiser um namespace contíguo ao seu nome de domínio "real", tente algo como "ad.company.com". Deixe o "company.com" fora disso.
Editar:
Agora eu acho que vejo onde você está indo. Você deve estar realmente atualizado sobre como o DNS é usado pelo Active Directory ( < href="http://technet.microsoft.com/pt-br/library/cc759550(WS.10).aspx"> link ). Você realmente quer para hospedar o DNS do Active Directory localmente!
O DNS do seu nome de domínio da Internet (para seu e-mail, site, etc) absolutamente deve ser hospedado externamente , mas isso não precisa ser (e realmente não deveria ser) o mesmo nome de domínio que você usa para o seu nome de domínio do Active Directory.
Seu host DNS externo provavelmente não suportará todos os recursos necessários para que o Active Directory funcione corretamente em seus servidores DNS. Em particular, eles provavelmente não suportarão o registro dinâmico de DNS ou atualizações seguras baseadas em GSSAPI.
Além disso, todos os seus computadores clientes e servidores de domínio precisarão do DNS para fazer coisas básicas, como logons e aplicativos da política de grupo. Você não quer amarrar isso à sua conexão com a Internet!
Você precisa usar um computador com Windows Server para hospedar o próprio Active Directory. É prática comum também usar esses computadores de controlador de domínio para hospedar o DNS do Active Directory (e frequentemente encaminhar solicitações de outros nomes para os servidores DNS do ISP ou os servidores DNS raiz) e usar esses servidores DNS como servidores DNS para todos os domínios. -membro de clientes e servidores.