Parece que o erro ocorreu porque eu já havia tentado criar contêineres lxc e o kernel do Ubuntu-touch atualmente não suporta isso.
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eDevise e Bjarne Roß fornecem métodos de trabalho para destruir contêineres em suas respostas. A maneira mais "correta" é a seguinte sintaxe
libertine-container-manager destroy -i container_name
Conforme destacado nos comentários do bug, esse não é um problema que deve afetar os usuários a partir de agora.