Use um disco EBS persistente como meio de armazenamento - ele funcionará exatamente como um volume regular, mas continuará existindo após o término da instância (observe que os volumes da raiz do EBS NÃO são persistentes por padrão).
Dependendo da configuração específica, você pode manter todos os dados no volume do EBS e, sempre que iniciar a instância, anexar o volume do EBS e continuar processando os dados ou usar o volume do EBS como armazenamento temporário, salvando os dados que foi totalmente processado para um local externo (por exemplo, S3). De qualquer maneira, o EBS deve fazer parte de sua configuração para fornecer uma continuação contínua de onde a última instância parou e fornecer a melhor taxa de transferência de dados.