Regra número 1 ao pensar em usar um wiki em uma empresa. Se não for fácil de usar, não será usado.
Eu tenho dificuldade em recomendar o MediaWiki para uso da empresa devido à regra acima e não tem controles de acesso. Existem vários plugins que tentam bloquear o MediaWiki, mas sem que isso seja feito no código principal, não sei ao certo o quão bem eles funcionam. Mas você deve ler o aviso no topo desta página.
Eu usei MoinMoin em algumas empresas e tive sorte com isso. Ele possui um editor WYSIWYG e permite que você cole o Word além da linguagem de marcação padrão. Mas qualquer wiki focado na experiência do usuário final e com controles de acesso apropriados deve funcionar.