Se você está falando de instalações adicionais com essas chaves, elas não serão ativadas depois que você parar de pagar.
Em relação ao software já instalado / ativado, vai depender de qual assinatura você está. Não tenho a pretensão de saber todas as permutações, mas sei que as nossas licenças MSDN de Parceiro Gold só são válidas enquanto continuarmos a pagar as taxas de assinatura anual. Se pararmos de pagar, desinstalaremos tudo imediatamente.
Outros programas, em contraste, permitem que você use o que você instalou por quanto tempo desejar, embora não seja possível registrar cópias adicionais nem fazer o download do MSDN após a data de expiração.
Chame seu número de suporte do MSDN e pergunte. Eu fiz várias perguntas de licenciamento sem ativar nenhuma auditoria. ;)