Eu apenas tentei isso em uma máquina equipada com um LSI 3108. Eu coloquei oito drives, configurei seis deles como um RAID6, rotulei-o, instalei um sistema de arquivos (XFS) e montei-o. Então eu coloco alguns dados no FS montado.
Depois disso, habilitei o modo JBOD com storcli64 /c0 set jbod=on
as duas unidades restantes imediatamente exibidas como dispositivos unix e o volume RAID existente permaneceu intacto. Eu até mesmo verifiquei isso lendo e escrevendo para ele.
Pelo menos em um 3108, eu posso misturar modos. Eu ficaria surpreso se o LSI / Avago permitisse um interruptor de modo sem avisar sobre um possível problema. Suas utilidades são bastante sólidas.