Encontre quem configurou o servidor e atire neles?
O ajuste HTTP preencheria um livro grande. Mas olhando para as informações que você forneceu ...
O ferro grande é um desperdício de tempo e dinheiro para servidores web - você obtém desempenho / disponibilidade / valor muito melhores em várias máquinas de baixo custo.
Por que o httpd está sendo executado em uma prioridade de agendamento anormalmente alta? Por que sua sessão ssh está sendo executada com uma prioridade menor que o sshd?
Seus processos do apache parecem ter uma pegada bem grande - você removeu os módulos que não está usando? No entanto, parece que seu maior problema é a quantidade de CPU usada pelo Apache - o PHP gosta da CPU. E o magento é particularmente faminto de CPU.
No entanto, a carga não é tão ruim considerando a quantidade de hardware que você tem. Digamos que você tenha processadores 16x4, mas as principais capturas de tela mostram apenas 6 processos usando uma quantidade significativa de CPU. Você está tentando reduzir a carga ou aumentar o desempenho? Front end ou back end?
Colocar um proxy reverso na frente do Apache ajudará com o desempenho (supondo que você tenha configuração de cache e compactação corretamente para o conteúdo) - IMHO Varnish ou nginx são muito eficazes. Ambos fornecem suporte a ESI - mas você precisará de algumas mudanças no Magento para suportar isso. Além de lidar com a veiculação de conteúdo estático com menos esforço, o proxy pode liberar o recurso httpd mais rapidamente e concluir o processo de envio da página pela rede com menos esforço.
Onde você está armazenando os dados da sua sessão? Se for o manipulador padrão, convém movê-lo para o memcache (a implementação do couchbase tem várias vantagens técnicas).
Verifique suas estatísticas da APC para ter certeza de que tem memória suficiente para armazenar a maior parte do código.