Eu diria que geralmente não. A versão recente do Outlook faz um bom trabalho, na minha experiência, de não usar arquivos associados a outro perfil MAPI e praticamente não há "sangramento" de configurações entre perfis MAPI diferentes.
Se você estiver preocupado com a interação com os perfis MAPI existentes e com os arquivos de dados do Outlook, poderá optar por renomear a chave do Registro (Subsistema \ Perfis de Mensagens HLCU \ Software \ Microsoft \ Windows NT \ CurrentVersion \ Windows) e o diretório contendo os arquivos ( a pasta AppData que você mencionou na sua pergunta) enquanto estiver solucionando problemas.
Editar:
Remover um grande arquivo OST (particularmente no mundo atual do Exchange hospedado, onde pode levar horas ou dias para re-armazenar em cache uma caixa de correio grande) parece algo que não deve ser feito de forma leve. Tenha isso em mente quando você iniciar nuking arquivos na pasta Outlook AppData. Mesmo com um servidor de caixa de correio na LAN, você pode ter uma caixa de correio de vários gigabytes para fazer o cache novamente quando o problema puder ser solucionado sem excluir o arquivo OST e criar o tráfego de rede e a utilização de recursos na infraestrutura do servidor. p>